Το 1989 με το Π.Δ. 377/1989, η Ανωτάτη Γεωπονική Σχολή Αθηνών (Α.Γ.Σ.Α.) μετεξελίσσεται σε Γεωργικό Πανεπιστήμιο Αθηνών αποτελούμενο από επτά ανεξάρτητα Ακαδημαϊκά Τμήματα. Παράλληλα, αρχίζει η αναβάθμιση της Βιβλιοθήκης καθώς προσλαμβάνεται ειδικευμένο προσωπικό. Το υλικό της εμπλουτίζεται με νέα βιβλία, ταξινομείται σε γενικές κατηγορίες και παρέχονται οι πρώτες υπηρεσίες της προς τους χρήστες. Η παρούσα κοινότητα περιλαμβάνει Διδακτορικές Διατριβές σε επίπεδο απλής εγγραφής. Στον χώρο της βιβλιοθήκης και σε ξεχωριστή συλλογή, διατηρείται μόνο η έντυπη έκδοση αυτών.