Φυλογενετική μελέτη στελεχών ψευδομονάδων με βάση γονίδιο του εκκριτικού συστήματος τύπου ΙΙΙ.

Abstract

Το γένος Pseudomonas περιλαμβάνει βακτήρια τα οποία αποτελούν παθογόνα όχι μόνο των φυτών και των ζώων αλλά και του ανθρώπου. Το είδος Pseudomonas syringae ανήκει στα είδη του γένους Pseudomonas με τη μεγαλύτερη οικονομική σημασία, ενώ περιλαμβάνει περισσότερους από 50 παθότυπους. Τα φυτοπαθογόνα βακτήρια Pseudomonas syringae χρησιμοποιούν ένα εκκριτικό σύστημα τύπου III για να μεταφέρουν πρωτεΐνες μολυσματικότητας, απευθείας στο κυτόπλασμα του ξενιστή τους. Προηγούμενες φυλογενετικές αναλύσεις αποκάλυψαν ότι ορισμένα από τα συντηρημένα γονίδια του εκκριτικού συστήματος τύπου III (hrc), μοιράζονται κοινή εξελικτική ιστορία με γονίδια ζωτικής σημασίας, υποδεικνύοντας ότι μπορούν να χρησιμοποιηθούν για την ταυτοποίηση των διαφόρων παθότυπων του P. syringae. Στην παρούσα εργασία χρησιμοποιήσαμε το γονίδιο hrcC για την ταυτοποίηση στελεχών που ανήκουν στο σύμπλεγμα P. syringae.

The genus Pseudomonas includes bacteria that are pathogens of both plants and animals and also humans. The species Pseudomonas syringae are the species of the genus Pseudomonas with the greatest economic importance, and includes more than 50 pathotypes. So the study and identification of different strains of the species is of particular importance. The plant pathogenic bacterium Pseudomonas syringae uses a type III secretion system to inject virulence proteins directly into the cytoplasm of its hosts. Previous phylogenetic analyses indicated that some of the conserved genes of the type III secretion system (hrc) share a common evolutionary history with the housekeeping genes, indicating that these genes could be used for the identification of P. syringae pathovars. In the present study, we used the hrcC gene to identify strains belonging to P. syringae complex.