Διερεύνηση της ομαδικής κινητικότητας ανταγωνιστικών βακτηρίων έναντι φυτοπαθογόνων μυκήτων

Abstract

Στην παρούσα μελέτη μελετήθηκαν δυο στελέχη του γένους Pseudomonas sp. τα οποία έχουν απομονωθεί από τη ριζόσφαιρα φυτών τομάτας σε συνθήκες θερμοκηπικής καλλιέργειας, όπου το έδαφος των θερμοκηπίων αυτών είχε υποστεί επέμβαση με σκοπό την απολύμανσή του, προ της καλλιέργειας των τοματόφυτων, με εφαρμογή βρωμιούχου μεθυλίου. Η ομαδική κινητικότητα των στελεχών Ρ14 και Ρ21 αξιολογήθηκε σε κατάλληλα τρυβλία με περιεκτικότητα σε άγαρ 0,5% και 1,5% και βρέθηκε ότι και τα δυο στελέχη αυτά μπορούν να κινηθούν ομαδικά σε τρυβλία με άγαρ συγκέντρωσης 0,5%, ενώ το βακτηριακό στέλεχος Ρ14 παρουσιάζει έντονο φαινότυπο ομαδικής κινητικότητας και σε τρυβλία με άγαρ συγκέντρωσης 1,5%. Τα στελέχη Ρ14 και Ρ21 ταυτοποιήθηκαν με βάση τις αλληλουχίες του 16S rRNA και η φυλογενετική ανάλυση έδειξε ότι τα στελέχη Ρ14 και Ρ21 ομαδοποιούνται με τα είδη Pseudomonas azotoformans και Pseudomonas jessenii, αντίστοιχα. Η ανταγωνιστική δράση των στελεχών αυτών αξιολογήθηκε έναντι των φυτοπαθογόνων μυκήτων Botrytis sp., Fusarium oxysporum, Phytophthora sp. και Rhizoctonia sp.. Με βάση τα αποτελέσματα της παρούσας εργασίας και τα δυο στελέχη αποτελούν καλούς ανταγωνιστές έναντι των συγκεκριμένων φυτοπαθογόνων μυκήτων, ιδιαίτερα όταν καλλιεργούνται σε κατάλληλα τρυβλία που ευνοούν την ανάπτυξη του φαινοτύπου της ομαδικής κινητικότητας, γεγονός που πιθανά οφείλεται στην παραγωγή και την έκκριση σημαντικών ποσοτήτων αντιμικροβιακών ενώσεων κατά την ομαδική κινητικότητα.

In this study, native Pseudomonas spp. isolates were obtained from tomato rhizosphere from soil which has been previously subjected to fumigation treatment with methyl bromide. The swarming motility of these isolates was evaluated on nutritient plates containing 0,5% agar (swarming plates) and on nutritient plates containing 1,5% agar. Both strains isolated displayed a convincing surface motility phenotype when propaged on nutrient plates containing 0,5% agar and in addition to this, strain P14 displayed a convincing surface motility phenotype when propaged on nutritient plates containing 1,5% agar. A phylogenetic analysis based on the 16S rRNA gene sequences confirmed that the isolates P14 and P21 belonge to the species Pseudomonas azotoformans and Pseudomonas jessenii, respectively. The antagonistic activity of the isolates against the phytopathogenic fungi Botrytis sp., Fusarium oxysporum, Phytophthora sp.and Rhizoctonia sp was evaluated in vitro. Both strain isolated exhibited antagonism towards the phytopathogenic fungi and their antagonistic activity seems to be associated with the swarming motility phenotype. It is possible that the swarming motility of both isolates results in the enhanced production and excretion of antimicrobial compounds.