Μοριακή ταυτοποίηση και χαρακτηρισμός γονιδίων που κωδικοποιούν λιποπεπτίδια και άλλα γονίδια, τα οποία εμπλέκονται στο βιολογικό έλεγχο και στην ομαδική κίνηση του στελέχους Pseudomonas fluorescens X

Abstract

Το βακτηριακό στέλεχος Pseudomonas fluorescens X, αποτελεί ένα πολύ καλό ανταγωνιστικό στέλεχος εναντίον πολλών παθογόνων μικροοργανισμών, συμπεριλαμβανομένων των φυτοπαθογόνων μυκήτων, Pythium ultimum, Phytopthora infestans, Rhizoctonia solani, Fusarium oxysporum και Botrytis cinerea. Τόσο το βακτηριακό στέλεχος Ps. fluorescens X όσο και τα μεταλλαγμένα βακτηριακά στελέχη του Pseudomonas fluorescens p93 και δ40, έχουν την ικανότητά να αναχαιτίζουν την ανάπτυξη αυτών των μικροοργανισμών με την άμεση καταστροφή των μυκηλιακών υφών των μυκήτων, εμφανίζοντας πολύ έντονη ομαδική κινητικότητα και την έκκριση του επιφανειοδραστικού κυκλικού λιποπεπτιδίου με αντιβιοτική δράση, massetolide A. Η έκκριση των βακτηριακών πρωτεϊνών- τελεστών στον εξωκυττάριο χώρο, αποτελεί βασικό βήμα στην παθογένεια και τη βακτηριακή μολυσματικότητα. Το πιο πρόσφατα μελετώμενο εκκριτικό σύστημα είναι το T6SS (τύπου VI εκκριτικό σύστημα), που μπορεί να μεταφέρει τους μολυσματικούς παράγοντες τόσο στο εξωκυττάριο μέσο, είτε απευθείας στο κύτταρο στόχο. Με τη μοριακή ανάλυση που πραγματοποιήθηκε, ταυτοποιήθηκε πλήρως η νουκλεοτιδική αλληλουχία των γονιδίων των μη ριβοσωμικών πεπτιδικών συνθετασών (NRPS), που εμπλέκονται στην παραγωγή του αντιβιοτικού massetolide A, ενώ ανιχνεύτηκε και το σύμπλεγμα των γονιδίων που κωδικοποιούν για το τύπου VI εκκριτικό σύστημα.

The bacteria Pseudomonas fluorescens X, is a competitive bacterial strain against several pathogenic microorganisms, including the phytopathogenic fungi Pythium ultimum, Phytopthora infestans, Rhizoctonia solani, Fusarium oxysporum and Botrytis cinerea. The bacterial strain Ps. fluorescens X and its mutant strains Pseudomonas fluorescens p93 και δ40 have the ability to inhibit the growth of these microorganisms by direct destruction of filamentous hyphae of the fungi, displaying a great swarming motility and secreting the cyclic lipopeptide surfactant with antibiotic activity, massetolide A. The secretion of the bacterial protein- effectors into the extracellular space plays an important role in bacterial pathogenesis and virulence. The most recently studied secretion system is the T6SS (type VI secretion system), which can transfer the infectious agents into the extracellular medium, either directly into the target cell. With the molecular analysis, the nucleotide sequence of Non- Ribosomal Peptide Synthetases (NRPS), which are involved in production of the massetolide A antibiotic, was fully identified, whereas at the same time the gene complex encoding for the type VI secretion system was also detected.