Μελέτη πληθυσμιακής δομής και εφαρμογή καινοτόμων εργαλείων για τη διάγνωση και αντιμετώπιση του Γλοιοσπορίου

Abstract

Η ασθένεια του Γλοιοσπορίου ή ανθράκνωση, που προκαλείτε από μύκητες του γένους Colletotrichum, είναι η πιο σοβαρή προ-συλλεκτική και μετά-συλλεκτική μυκητολογική ασθένεια του ελαιόκαρπου, σε παγκόσμιο επίπεδο. Η ασθένεια έχει εμφανιστεί σε πάρα πολλές ελαιοπαραγωγικές χώρες του κόσμου, προκαλώντας μεγάλες απώλειες στην παραγωγή, όπως και υποβάθμιση της ποιότητας του παραγώμενου ελαιολάδου. Στην Ελλάδα, μετά από μοριακή ταυτοποίηση των παθογόνων που απομονώθηκαν, επιβεβαιώθηκε ότι το κύριο παθογόνο αίτιο της ασθένειας είναι ο μύκητας Colletotrichum acutatum s.s. Η ασθένεια εκδηλώνεται περισσότερο στους ώριμους καρπούς, όμως μπορεί επίσης να εκδηλωθεί και σε άλλες δομές του δένδρου (φύλλα, άνθη, ποδίσκοι, μίσχοι και βλαστοί). Στα πλαίσια της παρούσας μελέτης πραγματοποιήθηκαν: 1) Δειγματοληψίες ταξιανθιών, καρπών και βλαστών ελιάς από διάφορες περιοχές της Ελλάδας, για την απομόνωση και τη μελέτη της πληθυσμιακής διακύμανσης των στελεχών Colletotrichum spp. 2) Μοριακή ανίχνευση του παθογόνου μύκητα Colletotrichum acutatum σε δείγματα ταξιανθιών και καρπών ελιάς, με τη μέθοδο RT-PCR TaqMan probe. 3) Αξιολόγηση της μυκοτοξικότητας χημικών σκευασμάτων έναντι στελεχών Colletotrichum spp. και έλεγχος ανθεκτικότητας των στελεχών αυτών 4) Αξιολόγηση της ικανότητας χημικών σκευασμάτων να παρεμποδίζουν την ανάπτυξη του μύκητα Colletotrichum acutatum, σε καρπούς ελιάς. 5) Ιn vitro αξιολόγηση της ικανότητας του βιολογικού παράγοντα Bacillus amyloliquefaciens στέλεχος MBI600 (εμπορική ονομασία Serifel®) να παρεμποδίζει την ανάπτυξη των μυκήτων Colletotrichum spp. 6) Αξιολόγηση της ικανότητας του βιολογικού μυκητοκτόνου Serifel® να παρεμποδίζει την ανάπτυξη του μύκητα Colletotrichum acutatum, σε καρπούς ελιάς. Από τα αποτελέσματα των δοκιμών της μελέτης προέκυψε ότι με την μοριακή μέθοδο RT-PCR TaqMan probe είναι δυνατή η ανίχνευση του μύκητα από διάφορους φυτικούς ιστούς της ελιάς και σε πολύ μικρές συγκεντρώσεις μολύσματος. Επίσης, από τα χημικά σκευάσματα που αξιολογήθηκαν, Insgnia® (δ.ο. pyraclostrobin χημική όμαδα στρομπιλουρινών), Revyona® (δ.ο. mefentrifluconazole χημική ομάδα τριαζολών), Nordox® (δ.ο. copper oxide χημική ομάδα χαλκούχων), το Insgnia® παρουσιάστηκε ως το πιο αποτελεσματικό. Τέλος, το βιολογικό μυκητοκτόνο Serifel® παρουσίασε χαμηλή αποτελεσματικότητα και απαιτείται περεταίρω πειραματισμός για την αξιολόγηση της δράσης του, έναντι του μύκητα Colletotrichum acutatum στην ελιά.

Olive anthracnose, caused by the fungus Colletotrichum spp., is the most serious pre-harvest and post-harvest disease of olive fruit, worldwide. The disease has been reported from many olive-producing countries of the world, causing important yield losses and degradation of oil quality. In Greece, after molecular characterization of the pathogens that had been isolated, it was confirmed that the main causual agent of the disease is the fungus Colletotrichum acutatum s.s. The disease affects mostly ripe olive fruits but it can also affect and other tree structures (leaves, flowers, twigs, pedicels and petioles). The aim of the present study was: 1) Collection of samples of olive flowers, olive fruits and olive stems from several regions of Greece, in order to isolate and investigate the population dynamics of the pathogens, belonging to the genus Colletotrichum. 2) Molecular detection of the pathogenic fungus Colletotrichum acutatum, in olive flowers and olive fruits samples, using RT-PCR TaqMan probe method. 3) Evaluation of chemicals fungicides against Colletotrichum spp. fungal isolates and resistance testing of the particular isolates. 4) Evaluation of chemicals fungicides against Colletotrichum acutatum, in olive fruits. 5) Evaluation In vitro of Bacillus amyloliquefaciens strain MBI600 (commercial brand Serifel®) against Colletotrichum spp. 6) Evaluation of the biological fungicide Serifel® (Bacillus amyloliquefaciens strain MBI600) against C. acutatum pathogenic fungus, in olive fruits. The results of this study demonstrate that with RT-PCR TaqMan probe detection method we are able to detect C. acutatum in various plant tissues and in very low infection rate. From the tested chemicals fungicides, Insgnia® (a.i. pyraclostrobin, strobilurins chemical group), Revyona® (a.i. mefentrifluconazole, triazoles chemical group), Nordox® a.i. copper oxide, copper based fungicides), Insgnia® was the most effective. Finally, Serifel® (Bacillus amyloliquefaciens strain MBI600) Biofungicide has shown very efficacy against C. acutatum, so further experimentation is required for better evaluation of the formulation.